熒光定量PCR是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于測量特定DNA或RNA序列在樣本中的數(shù)量。自20世紀(jì)90年代中期問世以來,qPCR已成為生命科學(xué)研究中重要的工具,尤其在基因表達(dá)分析、基因突變檢測、病原體定量等領(lǐng)域發(fā)揮著重要作用。
一、原理
熒光定量PCR基于PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù),通過在PCR反應(yīng)過程中加入熒光染料或特異性探針,實(shí)時(shí)監(jiān)測產(chǎn)物量的變化。隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,目標(biāo)DNA或RNA序列呈指數(shù)級擴(kuò)增,熒光信號也隨之增強(qiáng)。通過對熒光信號的捕捉和分析,可以精確計(jì)算出目標(biāo)序列的起始拷貝數(shù)。
二、技術(shù)特點(diǎn)
1、高靈敏度:能夠檢測到極低濃度的目標(biāo)序列,甚至單個(gè)拷貝。
2、高特異性:通過引物設(shè)計(jì)和探針選擇,可以精確識別目標(biāo)序列,避免非特異性擴(kuò)增。
3、實(shí)時(shí)性:在PCR過程中實(shí)時(shí)監(jiān)測熒光信號,無需后續(xù)處理即可獲得結(jié)果。
4、定量準(zhǔn)確性:可以對目標(biāo)序列進(jìn)行絕對定量或相對定量,結(jié)果準(zhǔn)確可靠。
5、高通量:可以同時(shí)檢測多個(gè)目標(biāo)序列,提高實(shí)驗(yàn)效率。
三、實(shí)驗(yàn)流程
1、樣本處理:根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求對樣本進(jìn)行預(yù)處理,如DNA/RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄等。
2、引物與探針設(shè)計(jì):根據(jù)目標(biāo)序列設(shè)計(jì)特異性引物和探針。
3、PCR反應(yīng)體系配制:將引物、探針、熒光染料等試劑加入PCR反應(yīng)體系中。
4、實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增:在熒光定量PCR儀上進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增,記錄熒光信號變化。
5、數(shù)據(jù)分析:利用軟件對熒光信號進(jìn)行分析,計(jì)算目標(biāo)序列的起始拷貝數(shù)。
四、熒光定量PCR的應(yīng)用
1、基因表達(dá)分析:通過比較不同樣本中特定基因的表達(dá)水平,研究基因在不同條件下的表達(dá)模式。
2、病原體檢測與定量:在病毒、細(xì)菌等病原體檢測中,通過qPCR可以準(zhǔn)確測量病原體載量,評估感染程度和治療效果。
3、基因突變篩查:用于檢測基因突變、基因融合等遺傳變異,為疾病的早期診斷和個(gè)性化治療提供依據(jù)。
4、轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測:在農(nóng)業(yè)、食品等領(lǐng)域,用于檢測轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的含量和純度。
5、藥物研發(fā):在藥物研發(fā)過程中,通過qPCR評估藥物對目標(biāo)基因表達(dá)的影響,為藥物療效和安全性研究提供數(shù)據(jù)支持。